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不同蛋白提取液對動物組織全蛋白質組鑒定的影響

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目前利用高分辨質譜儀能夠對細胞的全蛋白質組進行深度覆蓋,鑒定細胞內接 近全蛋白質組的蛋白數目[1-3],同時對于多種生物學過程中所涉及的翻譯后修飾 也能進行深度的鑒定和定量[4]。質譜儀的能力和樣品前處理是影響實驗結果的兩 大重要因素,本文主要分析樣品前處理過程中不同蛋白提取液對動物組織全蛋 白質組鑒定的影響

 

細胞裂解和蛋白質提取一般采取機械和物理兩種方法相結合。傳統的機械裂解 如研磨、反復凍融、超聲與溶液內剪切等對細胞進行破碎,為了提高蛋白提取 效率,機械裂解的同時加入表面活性劑或變性劑,破壞細胞及細胞器脂膜同時 增加蛋白溶解度[5]。常用的表面活性劑分為離子型、兩性離子型和非離子型三大 類,常添加的非離子型表面活性劑有 Triton X-100 和 NP-40 二者可使蛋白質 小化變性;離子型的表面活性劑 SDS,可*溶解細胞膜,蛋白提取效率高, 但蛋白質*變性失活。常用的蛋白變性劑如尿素和鹽酸胍,能夠斷裂蛋白氫 鍵,使蛋白發生不同程度的變性,同時增大疏水氨基酸殘基在水相中的溶解度。 因此根據實驗目的、樣品類型以及樣品量選擇合適的機械裂解與蛋白提取液, 將有助于提高蛋白質組研究的深度

 

液相色譜儀:EASY nLC1000(ThermoFisher Scientific)
分析柱:自制 C18 納升級噴針柱,長度 15 cm,
內徑 75 µm,粒徑 3 µm
流動相:A,0.1% 甲酸 / 水;B, 0.1% 甲酸 / 乙腈

 

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