以下是針對 Coriell Institute(科里爾研究所)的人類基因組DNA標準品的推薦,結合其特色產品和不同研究需求進行分類整理:
一、 Coriell 核心產品推薦
(1) 正常健康對照DNA
產品名稱:NA系列標準品(如NA12878、NA19240等)
全基因組測序(WGS)、外顯子組測序(WES)的基準對照。
實驗室間數據可比性驗證(如GATK最佳實踐中的標準樣本)。
來自健康供體的淋巴母細胞系(LCLs),經EB病毒永生化。
提供高純度、高完整性的DNA(濃度50-100 ng/μL)。
廣泛用于NGS測序技術驗證(如NIST基因組參考材料)。
(2) 疾病特異性DNA
產品系列:Coriell Biorepository
提供詳細的臨床表型和基因型數據(突變位點、遺傳模式)。
部分樣本含家系配對(患者+正常親屬),適合遺傳分析。
遺傳病樣本:如囊性纖維化(CFTR基因突變)、亨廷頓病(HTT重復擴展)、脊髓性肌weisuo(SMA)等。
腫瘤相關樣本:乳腺癌(BRCA1/2突變)、林奇綜合征(錯配修復基因突變)等。
神經退行性疾病:阿爾茨海默病(APP/PSEN1突變)、帕金森病(LRRK2突變)等。
(3) NIST認證參考材料
產品名稱:NIST Reference Materials(如GM12878)
與NIST合作開發的quanwei標準品(如NIST SRM 2372)。
提供已知SNP、Indel、結構變異等位點的基準數據。
適用于臨床診斷實驗室的合規性驗證(CLIA/CAP認證)。
二、按研究領域推薦
(1) 遺傳病研究
推薦產品:
HD100:亨廷頓病(CAG重復擴增)患者DNA。
CFTR系列:囊性纖維化相關突變(如ΔF508純合/雜合)。
用途:基因分型(PCR、Sanger測序)、攜帶者篩查方法開發。
(2) 腫瘤基因組學
推薦產品:
BRCA1/2突變樣本:如AG06840(BRCA1 c.68_69delAG)、AG07095(BRCA2 c.5946delT)。
腫瘤-正常配對樣本:部分細胞系提供癌組織與正常組織的配對DNA。
用途:體細胞突變檢測、液體活檢技術驗證。
(3) 群體遺傳學與多樣性
推薦產品:
HapMap項目樣本:如NA10851(歐洲裔)、NA18507(東亞裔)。
1000 Genomes樣本:涵蓋全球多個人群的基因組DNA。
用途:群體頻率分析、祖先信息標記(AIM)研究。
三、特色產品
(1) 定制化混合DNA
產品名稱:Custom DNA Mixes
按需混合不同突變型/野生型DNA(如EGFR T790M突變比例梯度)。
模擬腫瘤異質性或嵌合體樣本。
用途:檢測靈敏度/特異性評估(如ddPCR的LoD驗證)。
(2) FFPE模擬DNA
產品名稱:FFPE-like DNA Standards
通過化學處理模擬FFPE樣本的DNA片段化與損傷。
提供不同片段大小(100-1000 bp)和降解程度的選擇。
用途:腫瘤存檔樣本分析流程的優化。
(3) 無細胞DNA(cfDNA)標準品
產品名稱:Cell-Free DNA Reference Materials
含已知低頻突變(如1% VAF的KRAS G12D)。
模擬液體活檢中的腫瘤源性DNA。
用途:NGS建庫技術、液體活檢panel的性能驗證。
四、購買渠道
Coriell標準品代理——天津益元利康生物科技有限公司,提供NA12878等產品,歡迎咨詢選購。
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