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賽默飛為蛋白質(zhì)組學(xué)用戶量身打造的全新一站式工作流

閱讀:683      發(fā)布時間:2022-8-11
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作為后基因組時代的重要組成部分,蛋白質(zhì)組學(xué)經(jīng)過二十幾年的發(fā)展,已經(jīng)逐漸走向成熟。蛋白質(zhì)組學(xué)流程復(fù)雜,有較高的操作和實驗技能的要求。其完整的實驗步驟一般包括實驗設(shè)計、樣品前處理(蛋白提取、定量、酶解、脫鹽等)、LC-MS/MS分析、數(shù)據(jù)庫檢索、生物信息學(xué)分析等多重步驟,而針對蛋白質(zhì)組學(xué)步驟中繁瑣耗時或者實驗的穩(wěn)定性、通量等用戶的關(guān)注熱點,賽默飛推出全新的為所有的蛋白質(zhì)組學(xué)用戶量身打造的一站式工作流,以滿足用戶對高通量定性定量蛋白質(zhì)組學(xué)的全部需求。

△圖1:滿足高通量定性定量蛋白質(zhì)組學(xué)需求的

一站式工作流(點擊查看大圖)

賽默飛AccelerOme

自動化樣品前處理平臺

在蛋白質(zhì)組學(xué)中,最為困擾大家的當(dāng)屬樣品樣品的前處理制備過程,樣品制備過程繁瑣、耗時,欠缺標準化的處理步驟使得蛋白質(zhì)組學(xué)在不同的操作人員、不同的實驗室之間重復(fù)性較差。針對這個痛點,賽默飛推出了全新的全自動的蛋白質(zhì)組學(xué)樣品制備平臺AccelerOme(如圖2)。

△圖2:全自動的蛋白質(zhì)組學(xué)樣品制備平臺

(點擊查看大圖)

AccelerOme可完成蛋白樣品的還原烷基化、酶解、TMT標記、脫鹽、多肽定量等多步操作(如圖3),其具有強大的魯棒性的硬件,搭配現(xiàn)成的預(yù)配置的試劑以及直觀的端到端軟件,使標準化的蛋白質(zhì)組學(xué)制備流程走進萬千實驗室,解放雙手。

△圖3:AccelerOme自動化樣品前處理平臺在蛋白質(zhì)組學(xué)全流程中的作用

(點擊查看大圖)

其中,AccelerOme的強大的適配軟件,支持使用者們從實驗設(shè)計到數(shù)據(jù)分析的全流程。在蛋白質(zhì)組學(xué)以及生物制藥的HCP、藥代動力學(xué)實驗中,可幫助實驗人員更加簡便快速的獲得高質(zhì)量的、可重復(fù)的樣品。

全新的μPAC™

Neo HPLC色譜柱

在LC-MS/MS檢測中,我們希望低流速的納升液相能夠提供更加穩(wěn)健的表現(xiàn)和更高的日均檢測通量。為此,賽默飛于去年發(fā)布了全新的低流速液相Vanquish Neo,與之相匹配的,這次我們推出了全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色譜柱。

全新色譜柱優(yōu)勢

★與普通的填充柱不同,全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色譜柱為微柱蝕刻技術(shù),不同的色譜柱一致性強;

★同時低背壓設(shè)計,50cm色譜柱,300nl/min流速下,背壓僅110-150 bar;

★還可靈活適配于不同的工作流程,其可適配15-120min色譜梯度及5-500ng大范圍的上樣量。

全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色譜柱,在具有極其出色的性能的同時,兼具高度的魯棒性及更長的使用壽命(如圖4)。

△圖4:全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色譜柱多針上樣結(jié)果(從2月開始使用,間隔進行QC測試,共進行近500針QC測試)

(點擊查看大圖)

Proteome Discoverer™

3.0軟件搭配

CHIMERYS™搜索引擎

好馬配好鞍,除了前述的全新的自動化樣品前處理平臺、全新的色譜柱以及性能及其出色的Vanquish Neo低流速色譜儀和Orbitrap系列質(zhì)譜儀器,本次全新一站式蛋白質(zhì)組學(xué)工作流,還將推出升級版軟件Proteome Discoverer™ 3.0以及全新的智能搜索引擎CHIMERYS™。全新的CHIMERYS搜索算法是賽默飛與蛋白質(zhì)組學(xué)人工智能領(lǐng)域的領(lǐng)dao者MSAID™合作的全新一代為解析混合譜而設(shè)計的人工智能算法,這種革命性的算法可以大大提升DDA數(shù)據(jù)中被識別的PSMs數(shù),從而實現(xiàn)在鑒定數(shù)目上的性能斷層的巨大飛躍。

△圖5:CHIMERYS搜索引擎可以在復(fù)雜的混合譜中識別出更多的PSMs(點擊查看大圖)

△圖6:與前代軟件相比,CHIMERYS搜索引擎在鑒定量上帶來性能斷層的飛躍(點擊查看大圖)

CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段與蛋白的鑒定、非標記定量(LFQ)、TMT(包括TMT Pro)標記的定性與定量需求,未來也將支持翻譯后修飾等需求。

賽默飛全新一站式工作流,為蛋白質(zhì)組學(xué)用戶量身打造,可滿足用戶對高通量定性定量蛋白質(zhì)組學(xué)的全部需求。賽默飛與各位科學(xué)工作者們一起,在蛋白質(zhì)組學(xué)的領(lǐng)域里,揚帆起航,乘風(fēng)破浪!

結(jié)語

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