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天然藥物ABPP和SPR互作,大規模分子相互作用-分子對接

來源:分子互聯(北京)生物科技有限公司   2025年04月16日 20:17  

可進行天然藥物及仿生藥物,大規模分子相互作用研究如:

1. 對蛋白質、核酸、小分子、天然產物研究相互作用進行親和力、動力學的全面分析,如:KaKdKD、ΔG等等;

2. 篩選能和靶蛋白結合的活性分子,分子對接、虛擬篩選、AI+篩選等;

3. ABPPActivity-Based Protein Profiling)釣靶技術,藥靶篩選藥物分子;

4. 復合物的結構和組裝順序的分析。

5.天然產物藥物配伍、方證、循證醫學為基礎的藥效及精準醫學研究。

互作技術對比.png

不同的分子互作技術各有特點,選擇合適的技術取決于研究的具體需求和條件。

SPR:基于芯片表面PH,分子量,電荷,離子濃度,溫度)等離子共振強度表示信號高低,靈敏度較高。

BLI:和spr類似,基于光波干涉形成信號,相對適合大分子蛋白檢測。

MST:需要標記熒光分子如CY5,蛋白聚集、構象大小影響大,適合小分子至離子。

ITC:基于互作過程吸放熱提供熱力學參數(如ΔH、ΔS、ΔG)適合構象穩和小分子。

互作檢測范圍包括:

蛋白-蛋白、抗體-抗原、蛋白-小分子、抗體-多肽、蛋白-DNADNA-DNA、蛋白-納米材料等分子間相互作用力檢測;除了蛋白、抗體外,細胞裂解液、細菌等也可結合垂釣質譜等技術鑒定調控蛋白;也可在藥物篩選、醫療診斷、食品檢測、血液標志物檢測等領域有廣泛應用。

注意:樣品溶液中如含有NaN3、咪唑、蔗糖、DTT 等物質,需提前告知;如采用氨基偶聯的方式檢測,蛋白緩沖液中不能含有伯氨基的成分,如Tris 緩沖液。

SPR 檢測服務需經評估后確定對應的方案和價格。

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分子對接(molecular docking)是依據配體與受體作用的“鎖-鑰原理” (lock&key principle),模擬配體與受體分子相互作用的一種技術方法。分子識別的過程,主要包括靜電、氫鍵、疏水、范德華力等。分子互聯為廣大客戶提供基于AI技術的虛擬篩選、分子對接服務、分子互作濕試實驗驗證服務,預測藥物分子能否結合蛋白質分子、結合的方式、位置和穩定性等信息。內容涵蓋受體準備(去水、加氫、優化結構和能量最小化)、活性位點發現、蛋白柔性構象探索、配體構象數據庫準備、對接計算結果分析評價、小分子化合物庫制備、藥效團建模及篩選、人工經驗篩選等等。

分子對接應用:

1、配體和受體作用方式和結合構象;

2、篩選與靶點結合的先導化合物,化合物排序;

3、作用機理拓撲網絡組構建;

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我們目前可以為您提供以下交付內容:

蛋白/抗原/抗體—分子間親和力定性報告(定性分析),親和力測定報告(定量分析);結合常數(Ka)、解離常數(Kd)和 親和常數(KD; 親和力強弱排序;方證配伍研究報告。

周期:2-3周。


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