目錄:上海烜雅生物科技有限公司>>分子生物學試劑>>試劑盒>> miRNA 尿素-PAGE試劑盒
供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 30次 |
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貨號 | XY-D-1665 | 應用領域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | miRNA Urea-PAGE Kit |
保存條件 | -20℃ | 有效期 | 12個月 |
產(chǎn)品簡介:
尿素-聚丙烯酰胺凝膠電泳(Urea PAGE)是目前分離 200 nt 以下的小片段 RNA,尤其是 20 nt 左右的microRNA(miRNA)分子的主要方法,但是單獨配制各種溶液十分繁瑣,為此本公司開發(fā)了本產(chǎn)品。
產(chǎn)品特點:
1.一站式,含有電泳所需要的所有試劑,即開即用,十分方便,免去了實驗 人員稱取有毒物品。
2.靈活,可以根據(jù)需要配制各種濃度的 Urea-PAGE,以便對長度各異的RNA 進行電泳。
3.電泳后可直接用于 UV 觀察、銀染、膠回收、Northern 雜交等實驗。
4.使用新型上樣緩沖液,可以防止甘油的干擾。
產(chǎn)品參數(shù):
產(chǎn)品規(guī)格
本產(chǎn)品第一部分為大紙盒包裝,常溫運輸
成份規(guī)格包裝
尿素105 g×2250 mL 本色瓶
丙烯酰胺,電泳級60 g125 mL 棕色瓶
甲叉雙丙烯酰胺,電泳級3 g10 mL 棕色瓶
TBE 電泳液,10×250 mL250 mL 本色瓶
TEMED1.5 mL1.5 mL 白蓋管
過硫酸銨1 g1.5 mL 綠蓋管
固相 RNase 清除劑250 mL250 mL 本色瓶
使用手冊1 份1 份
成份規(guī)格包裝
2×miRNA 尿素
-PAGE 上樣液1.5 mL1.5 mL 紅蓋管
miRNA 電泳分子量
標準(15-50 nt)150 μL1.5 mL 藍蓋管
保存和運輸
miRNA 尿素-PAGE試劑盒常溫運輸和保存,其中 miRNAon、miRNA Marker 需要低溫運輸,-20℃保存,保存期一年。
自備試劑
miRNA 樣品、RNase-free 水。
使用方法:
1.準備工作:用固相 RNase 清除劑清潔工作平臺
直接將固相 RNase 清除劑原液或 10 倍的新鮮稀釋液噴于臺面,5 分鐘后用普通吸水紙擦凈,最后用沾有固相 RNase 清除劑 1000 倍新鮮稀釋液的吸水紙擦凈,晾干。
2.準備工作:用固相 RNase 清除劑清潔玻璃和塑料器皿將器皿浸泡在固相RNase 清除劑的 10 或 100 倍的新鮮稀釋液中,靜置處理 5 分鐘后取出, 再用固相 RNase 清除劑 1000 倍或 10000 倍新鮮稀釋液浸泡二次以上, 倒立晾干后備用。
3.配制 1×TBE 電泳液:將適量的 10×TEB 電泳液用 RNase-free 水稀釋 10 倍,得到 1×TBE 電泳液待用。此溶液需要現(xiàn)用現(xiàn)配,否則易長菌。
4.配制 10%過硫酸銨溶液:精確稱取約 100 mg 過硫酸銨到一干凈的 1.5 mL 離心管中,按每 1 mg 過硫酸銨加 10 μL RNase-free 水的比例加入 RNase-free 水,搖晃溶解待用。10%過硫酸銨溶液有效期不要超過一周。
5.估計所需要的凝膠溶液的體積,一般配制一塊 13 cm×15 cm×0.8 mm的膠需要 15 mL 凝膠溶液,配制一塊 36 cm×45 cm×0.8 mm 的膠需要 120 mL 凝膠溶液。
6.配制 40%的丙烯酰胺-甲叉雙丙烯酰胺溶液:將 3 g 甲叉雙丙烯酰胺全部倒入裝有 60 g 丙烯酰胺干粉的瓶中,加入 130 mL 自備的 RNase-free水,充分搖晃混勻即得 40%的 Acrylamide/Bis(20:1)溶液。
7.根據(jù)所需要的凝膠溶液的體積,在一的干凈的三角瓶中按下表加入各成分
(此處以配制 100 mL Acrylamide/Bis 終濃度為 15%的凝膠為例):
成份終濃度用量
尿素7 M42 g
40%Acrylamide/Bis 溶液15%37.5 mL
10×TEB 電泳液1×10 mL
補 RNase-free 水到 100 mL
注:Acrylamide/Bis 的終濃度需要根據(jù)待分離 RNA 長度選擇(見下表)。
需分離的 RNA 長度范圍Acrylamide/Bis 終濃度
6-100 nt20 %
25-150 nt15 %
40-200 nt12 %
8.攪拌并加熱到 40-50℃左右,直到尿素完-全溶解。
9.冷卻到室溫后,將三角瓶接上真空系統(tǒng)抽真空處理 10-15 分鐘以充分去除溶液中的氧氣(氧氣會降低聚合反應效率)。若條件有限,此步可省略。
10.邊搖晃溶液變加入 50 μL TEMED 和 500 μL10%過硫酸銨溶液。注意:如果選擇其他工作濃度的 Acrylamide/Bis,此二成分的用量不需要隨之改變。但如果配置的凝膠溶液的體積變化,此二成分的用量要按比例改變。
11.再充分搖晃約 30 秒后迅速灌膠,然后插入樣品梳,室溫放置 30-60 分鐘等待膠凝固。
12.將凝膠板放置在電泳裝置上后,在上下層分別加入適當量的 1×電泳緩沖液。如果不馬上使用,需要有濕紙將上樣孔端蓋住以防凝膠過度干燥。
13.拔出梳子后用加樣槍吸取電泳緩沖液,充分將每個加樣空中未聚合的Acrylamide/Bis、尿素和氣泡吹打出來。
14.在上樣前,預電泳 20-30 分鐘以使多余的過硫酸銨跑出加樣空,同時還可以使凝膠的溫度升高(到 50℃左右),有利于 RNA 變性狀態(tài)。
15.將 5 μL miRNA 樣品與和 5 μL miRNA 電泳分子量標準(15-50 nt)分別和 5 μL 的 2×miRNA 上樣液混合,70℃保溫 2-3 分鐘后迅速放置在冰上冷卻,快速離心半分鐘,放冰上待用??梢栽黾?miRNA 樣品的用量,但上液需要等比例增加。
16.關(guān)電泳儀后開始上樣。10 μL 混合液需要全部上樣。
17.重開電泳儀,對 13 cm×15 cm 的膠,以 20-30 mA 的電流電泳,直到紅色染料移動到凝膠邊緣為止;對 36 cm×45 cm 的膠,則以 50-60 mA 的電流電泳,直到紅色染料移動到凝膠邊緣為止。
18.染色觀察:將凝膠一面的玻璃板揭開,直接用仍然附著在另一玻璃板上的 凝膠進行各種染色,包括銀染(需單獨購買試劑盒)、EB 染色(每 100 mL 1×TBE 中加 20 μL 10 mg/mL 的 EB 溶液)、克必隆低毒核酸染料染色(每 100 mL 1×TBE 中加 10 μL 低毒核酸染料)。如果用后兩種染色法染色,需要在 UV 下觀察并拍照。本產(chǎn)品提供的 miRNA Marker有 5 條帶,從上到下的長度分別為:50 nt、40 nt、30 nt、20 nt 和 15 nt。
19.其它
后續(xù)處理(本試劑盒不含所需試劑),流程僅僅供參考。
miRNA 回收:在 UV 下確定所需要的 miRNA 條帶的位置,切膠后進行膠回收處理(需要單獨購買試劑盒)。
Northern 雜交:UV 觀察后將凝膠中的RNA 電轉(zhuǎn)移到帶正電的尼龍膜上,然后進行雜交處理。
放射自顯影:如果 miRNA 樣品電泳前經(jīng)過同位素標記,則將凝膠一面的玻璃板揭開,用濾紙將附著在另一玻璃板上的凝膠吸附過來,然后包上保
鮮膜,真空抽干,然后使膠跟 X 光片向?qū)χ眠M行放射自顯影。
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