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供貨周期 | 現貨 | 規格 | 5次 |
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貨號 | XY-D-1689 | 應用領域 | 化工,生物產業 |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | T3 invitroTranscription and Capping Kit |
保存條件 | -20℃ | 有效期 | 12個月 |
產品簡介:
本試劑盒是基于沙門氏噬菌體T3 RNA 聚合酶的RNA 體外轉錄及加帽試劑盒,它利用含有 T3 啟動子的模版 DNA,以 NTP 和 m7G(5' )ppp(5' )G 為底物從 T3 啟動子下游開始合成與模板 DNA 中一條鏈互補的 RNA,簡單快速獲得大量的 RNA 分子(含帶帽 RNA)。
產品特點:
1.即開即用,用戶只需提供含 T3 啟動子的 DNA 模板即可以進行體外轉錄實驗,不需單獨準備每一個成份。
2.體外轉錄和加帽同管一步式進行,不需要先體外轉錄再加帽。
3.單溶液預配液,減少加樣次數,避免了操作誤差,增加了可重復性。
4.模板 DNA 可以是線性化的質粒 DNA,也可以是 PCR 擴增產物。
5.可以合成的 RNA 的最佳長度在 20nt 到 5000nt 之問。
6.產品配方經過精心優化,每μg DNA 模板可以合成 2-6μg RNA。
7.得到的加帽 RNA 比不加帽的 RNA 更穩定,可以用于 RNA 結構研究、核解生物化學、體外翻譯、RNA-蛋白質相互作用、反義技術、SELEX 技術和 RNA 干擾(RNAi)等實驗。
產品參數:
成份規格包裝
2×T3 體外轉錄及加帽預配液50μL0.1mL 本蓋管
T3 RNA 聚合酶-RI 混合液5μL10μL 紅蓋管
RNase-free 水1mL1mL 藍蓋管
使用手冊1 份無
保存和運輸
T3體外轉錄及加帽試劑盒低溫運輸,-20℃保存,有效期一年。
自備試劑
如果需要去除轉錄產物中的 DNA 模板,則需要 RNase-free DNase、Tris 飽和
酚、氯仿、微量核酸沉淀劑、RNase-free 75%乙醇。
使用方法:
一、制備 DNA 模板
PCR 片段和質粒 DNA 都可以用作體外轉錄的模板,但是必須注意以下幾點。一是必須使用線性化的 DNA。如果是質粒 DNA,則必須先用適當的限制性內切酶切成線狀。二是需要轉錄的 DNA 序列的上游必須有 T3 啟動子。如果模板是 PCR 產物, 則可以在設計引物時將 T3 啟動子序列
(5’AATTAACCCTCACTAAAGG 3’)加上。如果是將 DNA 片段克隆
到載體上,則需要選擇有 T3 啟動子的載體,并且克隆位點必須位于 T3 啟動子下游。三是需要轉錄的 DNA 序列的下游端最好不要是 3’突出。如果
是 3’突出(如選擇了 Pst I 來線性化質粒),則最好用 T4 DNA 聚合酶修平。四是必須保證 DNA 模板中沒有 RNase。由于提取質粒 DNA 的過程中一般要使用大量的 RNase A,因此質粒 DNA 一般都有嚴重的 RNase A 污染,所以在用作模板前,最好采取膠回收得方法回收質粒 DNA。并且加入少量總 RNA 一起保溫,然后電泳檢測 RNA 是否被降解,以此判斷純化的DNA 模板是否有殘留 RNase A。
二、體外轉錄及加帽反應
1.如果有 N 個樣品,強烈建議做一個陰性對照,故共設置 N+1 個反應,這樣一起并排電泳時容易判斷哪個條帶是模板 DNA,哪個條帶是擴增得到的RNA。在 N+1 個 RNase-free 的塑料離心管中,在室溫下(不是在 4℃下)按次序加入下列成分:
注:此為 20μL 反應體系的用量,對其他體積的反應體系,各成分的用量可以按比例增減。如果需要標記 RNA 探針,則需要另購 NTP 與 2×T3 轉錄預配液分開提供的試劑盒。
2.37℃保溫 1-2 小時。注意:延長保溫時間并不能提高產量。
3.70℃加熱 10 分鐘滅活 T3 RNA 聚合酶。
4.取 1-3μL 電泳檢測轉錄效果。比陰性對照多出的條帶就是擴增得到的 RNA
(由于檢測時的電泳不需要堿變性膠,并且合成的 RNA 長度不一定均勻, 即使長度均勻,但由于自生形成發夾結構,因此不一定呈現清晰的電泳條帶。但由于 RNA 是單鏈,分子量比同樣長度的 DNA 小一倍,因此轉錄得到的 RNA 一般比其模板電泳速度更快。
5.定量,可以用自備的單鏈 RNA 定量試劑盒檢測濃度,也可以肉眼比較電泳膠上 RNA 和 DNA 的強度。由于 RNA 是單鏈,跟核酸染料結合力低,因此同等亮度的 RNA 條帶,其 RNA 分子數一般比 DNA 的分子數多一倍。1 μg DNA 模板一般可以合成 2-6μg 的 RNA(含帶帽 RNA)。
得到的 RNA 可以放-80℃保存(溶液中有 DNA 模板和未使用的 NTP)。注:若需進一步去除 T3 轉錄反應體系中的 DNA 模板,可參考下列操作步
驟,但所用試劑需另行購買,本試劑盒不提供。
1. 在體外轉錄結束后,在反應體系中加入 3-5 U 自備的 RNase-free DNase。 2. 37℃保溫 15-30 分鐘。
3.補水到 100μL,
4.用自備的等體積(100μL)的 Tris 飽和酚-氯仿抽提一次去除殘留的 DNase和 RNA 聚合酶。
5.在上清中加 200μL 自備的微量核酸沉淀劑(CAT#50903;用前需要搖晃混勻),振蕩后 15000 rpm 離心 3-5 分鐘,棄上清。
6.加入 1mL 75%乙醇,震蕩 10 秒后 15000 rpm 離心 3-5 分鐘,棄上清。
7.短暫離心數秒,用槍頭吸棄上清。
8.晾干半分鐘,所得沉淀即去除 DNA 模板后的 RNA。可溶于 RNase-free水中后立即使用或放-80℃長期保存。
選擇我們的T3體外轉錄及加帽試劑盒,就是選擇精準、高效、可靠的檢測方案,為您的科研實驗保駕護航!